Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCD1Q6ZMY3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms