Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LARP1Q6PKG0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LARP1Q6PKG0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms