Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A1Q6PCB7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms