Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LETMD1Q6P1Q0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms