Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NANOGP8Q6NSW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms