Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATL3Q6DD88 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms