Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6AWC8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6AWC8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6AWC8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6AWC8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6AWC8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6AWC8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6AWC8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms