Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LARP1BQ659C4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LARP1BQ659C4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms