Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLX4IPQ5VYV7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLX4IPQ5VYV7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms