Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT2Q5VUG0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT2Q5VUG0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms