Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms