Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC38Q5VT99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms