Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms