Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PERM1Q5SV97 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms