Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTP2Q5QGT7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms