Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPANXN3Q5MJ09 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms