Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFDP3Q5H9I0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFDP3Q5H9I0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms