Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KHDC3LQ587J8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KHDC3LQ587J8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms