Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKDCCQ504Y2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKDCCQ504Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms