Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC38Q502W7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC38Q502W7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms