Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HFEQ30201 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HFEQ30201 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HFEQ30201 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HFEQ30201 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HFEQ30201 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HFEQ30201 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HFEQ30201 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HFEQ30201 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms