Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIST3H3Q16695 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIST3H3Q16695 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIST3H3Q16695 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIST3H3Q16695 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIST3H3Q16695 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIST3H3Q16695 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HIST3H3Q16695 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HIST3H3Q16695 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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