Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDCD2Q16342 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD2Q16342 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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