Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F4Q16254 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F4Q16254 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F4Q16254 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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