Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTX1Q15818 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms