Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ITSN1Q15811 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITSN1Q15811 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITSN1Q15811 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
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