Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNHIT3Q15649 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNHIT3Q15649 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms