Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC23BQ15437 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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SEC23BQ15437 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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SEC23BQ15437 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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SEC23BQ15437 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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