Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTCH1Q13635 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTCH1Q13635 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTCH1Q13635 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms