Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLFQ13129 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLFQ13129 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLFQ13129 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RLFQ13129 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RLFQ13129 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLFQ13129 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RLFQ13129 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLFQ13129 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RLFQ13129 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RLFQ13129 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLFQ13129 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RLFQ13129 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms