Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWF1Q12792 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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