Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 SWI1YPL016W 3945 nt3.89□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 PHM6YDR281C 315 nt3.89□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 PDX1YGR193C 1233 nt3.89□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 MED4YOR174W 855 nt3.89□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 APL4YPR029C 2499 nt3.89□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 PHO87YCR037C 2772 nt3.88□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 DPH1YIL103W 1278 nt3.88□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 YOR292CYOR292C 930 nt3.88□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 SSU1YPL092W 1377 nt3.88□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 EMC1YCL045C 2283 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 MVD1YNR043W 1191 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 IDH2YOR136W 1110 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 RDS1YCR106W 2499 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 RTS1YOR014W 2274 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 LAP3YNL239W 1365 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 SMP1YBR182C 1359 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 BUD27YFL023W 2391 nt3.87□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 REB1YBR049C 2433 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 RTT103YDR289C 1230 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 BUD16YEL029C 939 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 FUR1YHR128W 651 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 CDC8YJR057W 651 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 GTR1YML121W 933 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 YNL181WYNL181W 1224 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 FDH1YOR388C 1131 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 snR37snR37 386 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 HCA4YJL033W 2313 nt3.86□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 SLA1YBL007C 3735 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 CDC45YLR103C 1953 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 ERB1YMR049C 2424 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 POL12YBL035C 2118 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 URA2YJL130C 6645 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 ARG80YMR042W 534 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 TOM40YMR203W 1164 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 snR3snR3 194 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 UBX5YDR330W 1503 nt3.85□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 PHO13YDL236W 939 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 DPB4YDR121W 591 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 YPT7YML001W 627 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 ECM8YBR076W 1065 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 PZF1YPR186C 1290 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 POF1YCL047C 777 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 IML2YJL082W 2196 nt3.84□□□□□ -1.79
RIO1Q12196 MSN4YKL062W 1893 nt3.84□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 IGO2YHR132W-A 396 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YBL010CYBL010C 843 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 ELC1YPL046C 300 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SPN1YPR133C 1233 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 ASI1YMR119W 1875 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 NSP1YJL041W 2472 nt3.83□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 TCB3YML072C 4638 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 PRP40YKL012W 1752 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 APP1YNL094W 1764 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 KRI1YNL308C 1776 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 MNT4YNR059W 1743 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 NUP159YIL115C 4383 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SNM1YDR478W 597 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YLR428CYLR428C 345 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SWP1YMR149W 861 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 WRS1YOL097C 1299 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YBR219CYBR219C 384 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SRS2YJL092W 3525 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YDL109CYDL109C 1944 nt3.82□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 STU1YBL034C 4542 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YJR030CYJR030C 2238 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 NSE1YLR007W 1011 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 RIM11YMR139W 1113 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SNF8YPL002C 702 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 RPS9BYBR189W 588 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SPA2YLL021W 4401 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YGL140CYGL140C 3660 nt3.81□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 MTR4YJL050W 3222 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 MSD1YPL104W 1977 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SWP82YFL049W 1872 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 MIG3YER028C 1185 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 SLX8YER116C 825 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 CAP2YIL034C 864 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 MAD2YJL030W 591 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 ANB1YJR047C 474 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 URA4YLR420W 1095 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 GZF3YJL110C 1656 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 UGA3YDL170W 1587 nt3.8□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 TED1YIL039W 1422 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 RNT1YMR239C 1416 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 POL1YNL102W 4407 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 ALA1YOR335C 2877 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 YEL074WYEL074W 339 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 COS4YFL062W 1140 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 RRP36YOR287C 903 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 DER1YBR201W 636 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 RRN6YBL014C 2685 nt3.79□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 TAF1YGR274C 3201 nt3.78□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 PMT6YGR199W 2280 nt3.78□□□□□ -1.8
RIO1Q12196 ARP10YDR106W 855 nt3.78□□□□□ -1.8
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