Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC15Q0P6D6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC15Q0P6D6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms