Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms