Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDR1Q08345 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DDR1Q08345 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDR1Q08345 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms