Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLEQ07864 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLEQ07864 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLEQ07864 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLEQ07864 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLEQ07864 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
POLEQ07864 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
POLEQ07864 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POLEQ07864 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms