Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABPAQ06546 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABPAQ06546 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms