Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX1T1Q06455 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX1T1Q06455 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms