Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN11Q06124 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN11Q06124 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN11Q06124 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms