Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ROM1Q03395 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms