Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4A11Q02928 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4A11Q02928 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms