Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIM1P81133 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIM1P81133 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SIM1P81133 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIM1P81133 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIM1P81133 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIM1P81133 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIM1P81133 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIM1P81133 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIM1P81133 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms