Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTA1P68133 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms