Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UFM1P61960 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UFM1P61960 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UFM1P61960 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UFM1P61960 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UFM1P61960 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UFM1P61960 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UFM1P61960 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UFM1P61960 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms