Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVK-21P61565 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVK-21P61565 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms