Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00315P59091 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms