Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCBP4P57723 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCBP4P57723 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms