Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBASH3AP57075 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBASH3AP57075 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms