Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP1P56182 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRP1P56182 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRP1P56182 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1P56182 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1P56182 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1P56182 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP1P56182 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1P56182 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1P56182 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1P56182 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1P56182 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP1P56182 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP1P56182 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1P56182 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1P56182 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1P56182 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1P56182 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1P56182 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP1P56182 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP1P56182 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP1P56182 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP1P56182 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP1P56182 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP1P56182 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP1P56182 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms