Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF3BP55884 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF3BP55884 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms